Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YAL037WYAL037W 804 nt2.58□□□□□ -2
LSP1Q12230 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.58□□□□□ -2
LSP1Q12230 CTK3YML112W 891 nt2.58□□□□□ -2
LSP1Q12230 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.58□□□□□ -2
LSP1Q12230 AMS1YGL156W 3252 nt2.57□□□□□ -2
LSP1Q12230 SNF12YNR023W 1701 nt2.57□□□□□ -2
LSP1Q12230 NEO1YIL048W 3456 nt2.57□□□□□ -2
LSP1Q12230 ARV1YLR242C 966 nt2.57□□□□□ -2
LSP1Q12230 RPL25YOL127W 429 nt2.57□□□□□ -2
LSP1Q12230 IRC16YPR038W 360 nt2.57□□□□□ -2
LSP1Q12230 ARR2YPR200C 393 nt2.57□□□□□ -2
LSP1Q12230 snR41snR41 95 nt2.57□□□□□ -2
LSP1Q12230 YOL057WYOL057W 2136 nt2.57□□□□□ -2
LSP1Q12230 GDS1YOR355W 1569 nt2.57□□□□□ -2
LSP1Q12230 MRP10YDL045W-A 288 nt2.56□□□□□ -2
LSP1Q12230 TIM11YDR322C-A 291 nt2.56□□□□□ -2
LSP1Q12230 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.56□□□□□ -2
LSP1Q12230 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.56□□□□□ -2
LSP1Q12230 YNL324WYNL324W 396 nt2.56□□□□□ -2
LSP1Q12230 SWM2YNR004W 441 nt2.56□□□□□ -2
LSP1Q12230 SEN54YPL083C 1404 nt2.56□□□□□ -2
LSP1Q12230 APC11YDL008W 498 nt2.55□□□□□ -2
LSP1Q12230 VAC8YEL013W 1737 nt2.55□□□□□ -2
LSP1Q12230 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.55□□□□□ -2
LSP1Q12230 FYV4YHR059W 393 nt2.55□□□□□ -2
LSP1Q12230 MUD2YKL074C 1584 nt2.55□□□□□ -2
LSP1Q12230 AIM29YKR074W 468 nt2.55□□□□□ -2
LSP1Q12230 DGK1YOR311C 873 nt2.55□□□□□ -2
LSP1Q12230 MES1YGR264C 2256 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 SCP160YJL080C 3669 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 RPI1YIL119C 1224 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 AYR1YIL124W 894 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 RPS29AYLR388W 171 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 PKR1YMR123W 369 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 PRM3YPL192C 402 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 snR43snR43 209 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 SSE1YPL106C 2082 nt2.54□□□□□ -2
LSP1Q12230 SSN2YDR443C 4263 nt2.53□□□□□ -2
LSP1Q12230 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.53□□□□□ -2
LSP1Q12230 RTR2YDR066C 591 nt2.53□□□□□ -2
LSP1Q12230 RAD6YGL058W 519 nt2.53□□□□□ -2
LSP1Q12230 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.53□□□□□ -2
LSP1Q12230 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.53□□□□□ -2
LSP1Q12230 HSP10YOR020C 321 nt2.53□□□□□ -2
LSP1Q12230 YJL181WYJL181W 1836 nt2.53□□□□□ -2
LSP1Q12230 BRE1YDL074C 2103 nt2.53□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 SPE1YKL184W 1401 nt2.52□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 MCD1YDL003W 1701 nt2.52□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YDL032WYDL032W 312 nt2.52□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 RNR4YGR180C 1038 nt2.52□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 BIG1YHR101C 1008 nt2.52□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 PEP12YOR036W 867 nt2.52□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YBT1YLL048C 4986 nt2.52□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 DUG2YBR281C 2637 nt2.52□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 UTP22YGR090W 3714 nt2.52□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 SPC1YJR010C-A 285 nt2.51□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 SIN3YOL004W 4611 nt2.51□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 BTT1YDR252W 450 nt2.5□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.5□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 RPL29YFR032C-A 180 nt2.5□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YMR31YFR049W 372 nt2.5□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 ERV1YGR029W 570 nt2.5□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YML108WYML108W 318 nt2.5□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 NOP15YNL110C 663 nt2.5□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YPL080CYPL080C 327 nt2.5□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.5□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 FIR1YER032W 2631 nt2.49□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YRB1YDR002W 606 nt2.49□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YPS5YGL259W 498 nt2.49□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 ECL1YGR146C 636 nt2.49□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 PAU14YIL176C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 PAU1YJL223C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 IGO1YNL157W 507 nt2.49□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YPL039WYPL039W 951 nt2.49□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 JIP5YPR169W 1479 nt2.49□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 SCH9YHR205W 2475 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 COG3YER157W 2406 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YFH1YDL120W 525 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YDR114CYDR114C 303 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 HUR1YGL168W 333 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YNL046WYNL046W 519 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 NSL1YPL233W 651 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 UTP13YLR222C 2454 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 TRM2YKR056W 1920 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 APL5YPL195W 2799 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 NPR3YHL023C 3441 nt2.48□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 IRA2YOL081W 9240 nt2.47□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 SKP2YNL311C 2292 nt2.47□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 TSA2YDR453C 591 nt2.47□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 GCN4YEL009C 846 nt2.47□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 SMB1YER029C 591 nt2.47□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 RTS3YGR161C 792 nt2.47□□□□□ -2.01
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