Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms