Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms