Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms