Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLEQ07864 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLEQ07864 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLEQ07864 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLEQ07864 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLEQ07864 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLEQ07864 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms