Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-1Q07627 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms