Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL16A1Q07092 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms