Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDSRQ06136 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDSRQ06136 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KDSRQ06136 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDSRQ06136 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDSRQ06136 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KDSRQ06136 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDSRQ06136 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDSRQ06136 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KDSRQ06136 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KDSRQ06136 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDSRQ06136 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KDSRQ06136 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms