Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms