Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

Predictions only

Length 3,268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 SUB1YMR039C 879 nt0.06□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YOR053WYOR053W 342 nt0.06□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YMR099CYMR099C 894 nt0.05□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YPK3YBR028C 1578 nt0.05□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 MUM3YOR298W 1440 nt0.05□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YOL050CYOL050C 321 nt0.05□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 EST2YLR318W 2655 nt0.05□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 RGL1YPL066W 1440 nt0.05□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YER133W-AYER133W-A 342 nt0.04□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YIL058WYIL058W 285 nt0.04□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 CYC1YJR048W 330 nt0.04□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 NGG1YDR176W 2109 nt0.04□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YBR206WYBR206W 324 nt0.04□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YNL018CYNL018C 1839 nt0.04□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 SNM1YDR478W 597 nt0.04□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 MRPL50YNR022C 420 nt0.04□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 ATG9YDL149W 2994 nt0.03□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YLR345WYLR345W 1530 nt0.03□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 SLU7YDR088C 1149 nt0.03□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 TAD1YGL243W 1203 nt0.03□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt0.03□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.03□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 MAL33YBR297W 1407 nt0.03□□□□□ -2.4
TOM1Q03280 HRT3YLR097C 1035 nt0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.02□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 YIP1YGR172C 747 nt0.02□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 MPD1YOR288C 957 nt0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 YPL225WYPL225W 441 nt0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 MSC6YOR354C 2079 nt0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 TSC13YDL015C 933 nt0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 YDL183CYDL183C 963 nt0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 BUR6YER159C 429 nt0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 TRM2YKR056W 1920 nt0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt0□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 VMA5YKL080W 1179 nt0□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 FMC1YIL098C 468 nt-0□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 UTP10YJL109C 5310 nt-0□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 ERV15YBR210W 429 nt-0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 TIM13YGR181W 318 nt-0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 CUR1YPR158W 759 nt-0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 SRP1YNL189W 1629 nt-0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 HSE1YHL002W 1359 nt-0.01□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 YNL043CYNL043C 321 nt-0.02□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 YCR016WYCR016W 873 nt-0.02□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 RPL40AYIL148W 387 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 CYB5YNL111C 363 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 MGR1YCL044C 1254 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 ARG2YJL071W 1725 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 ARP10YDR106W 855 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 TSA2YDR453C 591 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 MPO1YGL010W 525 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 YOR282WYOR282W 321 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 SCP1YOR367W 603 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 ESP1YGR098C 4893 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 SMY1YKL079W 1971 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOM1Q03280 ESC2YDR363W 1371 nt-0.04□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 YGR160WYGR160W 612 nt-0.04□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 YAE1YJR067C 426 nt-0.04□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 CTK3YML112W 891 nt-0.04□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 MCM10YIL150C 1716 nt-0.04□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 BTN2YGR142W 1233 nt-0.04□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 LTO1YNL260C 597 nt-0.05□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 MPS1YDL028C 2295 nt-0.05□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 RPL37AYLR185W 267 nt-0.05□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 GMC2YLR445W 567 nt-0.05□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 ALK1YGL021W 2283 nt-0.05□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 NUP188YML103C 4968 nt-0.05□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 RDN58-1RDN58-1 158 nt-0.06□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 RDN58-2RDN58-2 158 nt-0.06□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 CHS6YJL099W 2241 nt-0.06□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 YGL039WYGL039W 1047 nt-0.06□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 SPR2YOR214C 711 nt-0.07□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 snR190snR190 190 nt-0.07□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 RPL38YLR325C 237 nt-0.07□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 FUS2YMR232W 2034 nt-0.08□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 BTT1YDR252W 450 nt-0.08□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 IES4YOR189W 351 nt-0.08□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 CIK1YMR198W 1785 nt-0.08□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 NPC2YDL046W 522 nt-0.08□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt-0.08□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 SNX4YJL036W 1272 nt-0.09□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 HMLALPHA1YCL066W 528 nt-0.09□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 MATALPHA1YCR040W 528 nt-0.09□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt-0.09□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 YAL064WYAL064W 285 nt-0.09□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 TEN1YLR010C 483 nt-0.09□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 AIM41YOR215C 558 nt-0.09□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 SMA1YPL027W 738 nt-0.09□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 YIL080WYIL080W 4722 nt-0.1□□□□□ -2.42
TOM1Q03280 RSM26YJR101W 801 nt-0.1□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 PAU3YCR104W 375 nt-0.1□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 FIR1YER032W 2631 nt-0.11□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 NOP9YJL010C 2001 nt-0.11□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 APC2YLR127C 2562 nt-0.11□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 PIN4YBL051C 2007 nt-0.12□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 SLK19YOR195W 2466 nt-0.12□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 YPL034WYPL034W 498 nt-0.12□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt-0.12□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 TRM12YML005W 1389 nt-0.13□□□□□ -2.43
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