Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms