Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms