Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms