Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHDQ02161 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHDQ02161 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHDQ02161 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHDQ02161 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHDQ02161 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHDQ02161 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms