Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms