Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RELBQ01201 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RELBQ01201 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RELBQ01201 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RELBQ01201 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RELBQ01201 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms