Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms