Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms