Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms