Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms