Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS29P62273 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS29P62273 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS29P62273 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS29P62273 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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