Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK-21P61565 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-21P61565 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms