Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RWDD2BP57060 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RWDD2BP57060 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RWDD2BP57060 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RWDD2BP57060 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RWDD2BP57060 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RWDD2BP57060 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RWDD2BP57060 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RWDD2BP57060 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RWDD2BP57060 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RWDD2BP57060 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RWDD2BP57060 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms