Protein–RNA interactions for Protein: P56385

ATP5I, ATP synthase subunit e, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5IP56385 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5IP56385 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms