Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP1P56182 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP1P56182 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP1P56182 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP1P56182 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP1P56182 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP1P56182 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP1P56182 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP1P56182 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP1P56182 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP1P56182 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP1P56182 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RRP1P56182 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1P56182 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1P56182 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1P56182 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1P56182 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms