Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELLP55199 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELLP55199 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELLP55199 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms