Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms