Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms