Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms