Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX2P52951 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX2P52951 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX2P52951 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX2P52951 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX2P52951 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX2P52951 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX2P52951 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX2P52951 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX2P52951 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX2P52951 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GBX2P52951 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GBX2P52951 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms