Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA3P52797 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA3P52797 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA3P52797 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA3P52797 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA3P52797 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA3P52797 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA3P52797 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA3P52797 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA3P52797 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms