Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPNA1P52294 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms