Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP5P51878 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP5P51878 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP5P51878 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP5P51878 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP5P51878 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP5P51878 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP5P51878 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP5P51878 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP5P51878 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP5P51878 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms