Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCN5P51795 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLCN5P51795 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CLCN5P51795 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CLCN5P51795 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLCN5P51795 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCN5P51795 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms