Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSK3BP49841 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms