Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms