Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKI67P46013 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKI67P46013 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKI67P46013 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKI67P46013 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MKI67P46013 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKI67P46013 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKI67P46013 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKI67P46013 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKI67P46013 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKI67P46013 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKI67P46013 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKI67P46013 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKI67P46013 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKI67P46013 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKI67P46013 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKI67P46013 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKI67P46013 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKI67P46013 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKI67P46013 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKI67P46013 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKI67P46013 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKI67P46013 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKI67P46013 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKI67P46013 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKI67P46013 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKI67P46013 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKI67P46013 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKI67P46013 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKI67P46013 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKI67P46013 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKI67P46013 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKI67P46013 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKI67P46013 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKI67P46013 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKI67P46013 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKI67P46013 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKI67P46013 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKI67P46013 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKI67P46013 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms