Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETV4P43268 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV4P43268 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV4P43268 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV4P43268 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV4P43268 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV4P43268 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ETV4P43268 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ETV4P43268 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms