Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTTP42858 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HTTP42858 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTTP42858 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTTP42858 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HTTP42858 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTTP42858 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HTTP42858 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HTTP42858 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTTP42858 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTTP42858 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTTP42858 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTTP42858 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms