Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms