Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC5P40937 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC5P40937 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC5P40937 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC5P40937 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC5P40937 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC5P40937 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC5P40937 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC5P40937 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC5P40937 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC5P40937 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC5P40937 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC5P40937 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC5P40937 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC5P40937 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC5P40937 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC5P40937 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC5P40937 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC5P40937 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC5P40937 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC5P40937 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC5P40937 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC5P40937 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms