Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EIF4A3P38919 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4A3P38919 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms