Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms