Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 HUB1YNR032C-A 222 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE2P36075 HHF1YBR009C 312 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE2P36075 HCS1YKL017C 2052 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE2P36075 MYO5YMR109W 3660 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE2P36075 CCT7YJL111W 1653 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE2P36075 NOP4YPL043W 2058 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 DUF1YOL087C 3351 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YJL135WYJL135W 318 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 PRE8YML092C 753 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YPL039WYPL039W 951 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YPR136CYPR136C 513 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 SIN3YOL004W 4611 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YJL016WYJL016W 1686 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 CBP2YHL038C 1893 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 APC5YOR249C 2058 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE2P36075 STN1YDR082W 1485 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE2P36075 GCD6YDR211W 2139 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE2P36075 PUF6YDR496C 1971 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE2P36075 NPR2YEL062W 1848 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE2P36075 PSY1YKL076C 384 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE2P36075 VPS9YML097C 1356 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE2P36075 BNA4YBL098W 1383 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE2P36075 EGD1YPL037C 474 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE2P36075 VAC14YLR386W 2643 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE2P36075 UBP14YBR058C 2346 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YFH1YDL120W 525 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 ATP17YDR377W 306 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 TIF35YDR429C 825 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YER088C-AYER088C-A 324 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 NOP19YGR251W 591 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 RPL8BYLL045C 771 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 LSM2YBL026W 288 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YBL028CYBL028C 321 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 MDM1YML104C 3384 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 NMD2YHR077C 3270 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE2P36075 MSH2YOL090W 2895 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 FRE2YKL220C 2136 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YDR338CYDR338C 2088 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 VPS52YDR484W 1926 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 DYN2YDR424C 279 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 RPL26AYLR344W 384 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 HSP10YOR020C 321 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YBR064WYBR064W 429 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 NTC20YBR188C 423 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 PEX6YNL329C 3093 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 PSK1YAL017W 4071 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE2P36075 SPO14YKR031C 5052 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE2P36075 VPS3YDR495C 3036 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE2P36075 PMR1YGL167C 2853 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE2P36075 AKR1YDR264C 2295 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE2P36075 RKM1YPL208W 1752 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE2P36075 RPS29BYDL061C 171 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE2P36075 WIP1YDR374W-A 270 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YOR050CYOR050C 348 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE2P36075 FLO1YAR050W 4614 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE2P36075 SNX41YDR425W 1878 nt3.03□□□□□ -1.93
CUE2P36075 FUN30YAL019W 3396 nt3.03□□□□□ -1.93
CUE2P36075 RSN1YMR266W 2862 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 SCW11YGL028C 1629 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 RPL35AYDL191W 363 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 RPC10YHR143W-A 213 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 BAT1YHR208W 1182 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 RPL16BYNL069C 597 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 PFY1YOR122C 381 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 YOR302WYOR302W 78 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 ATG13YPR185W 2217 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 PDC2YDR081C 2778 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 STT4YLR305C 5703 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE2P36075 PCF11YDR228C 1881 nt3.01□□□□□ -1.93
CUE2P36075 URM1YIL008W 300 nt3.01□□□□□ -1.93
CUE2P36075 AYR1YIL124W 894 nt3.01□□□□□ -1.93
CUE2P36075 LCL2YLR104W 396 nt3.01□□□□□ -1.93
CUE2P36075 TAR1YLR154W-C 375 nt3.01□□□□□ -1.93
CUE2P36075 YPR053CYPR053C 456 nt3.01□□□□□ -1.93
CUE2P36075 RAD61YDR014W 1944 nt3.01□□□□□ -1.93
CUE2P36075 PRP39YML046W 1890 nt3.01□□□□□ -1.93
CUE2P36075 YEL1YBL060W 2064 nt3□□□□□ -1.93
CUE2P36075 SIN4YNL236W 2925 nt3□□□□□ -1.93
CUE2P36075 YKL100CYKL100C 1764 nt3□□□□□ -1.93
CUE2P36075 OSW7YFR039C 1533 nt3□□□□□ -1.93
CUE2P36075 RAX2YLR084C 3663 nt3□□□□□ -1.93
CUE2P36075 CDC26YFR036W 375 nt3□□□□□ -1.93
CUE2P36075 SLM6YBR266C 453 nt3□□□□□ -1.93
CUE2P36075 CEP3YMR168C 1827 nt3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms