Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt4.41□□□□□ -1.7
CSE4P36012 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt4.41□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YGR266WYGR266W 2106 nt4.4□□□□□ -1.7
CSE4P36012 TRS120YDR407C 3870 nt4.4□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt4.4□□□□□ -1.71
CSE4P36012 ARG2YJL071W 1725 nt4.4□□□□□ -1.71
CSE4P36012 RAD61YDR014W 1944 nt4.39□□□□□ -1.71
CSE4P36012 RPS24AYER074W 408 nt4.39□□□□□ -1.71
CSE4P36012 SOD1YJR104C 465 nt4.39□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YNL338WYNL338W 159 nt4.39□□□□□ -1.71
CSE4P36012 RSM19YNR037C 276 nt4.39□□□□□ -1.71
CSE4P36012 PEX11YOL147C 711 nt4.39□□□□□ -1.71
CSE4P36012 NMA111YNL123W 2994 nt4.39□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YSH1YLR277C 2340 nt4.39□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YJL016WYJL016W 1686 nt4.38□□□□□ -1.71
CSE4P36012 REV1YOR346W 2958 nt4.38□□□□□ -1.71
CSE4P36012 CDH1YGL003C 1701 nt4.38□□□□□ -1.71
CSE4P36012 STN1YDR082W 1485 nt4.38□□□□□ -1.71
CSE4P36012 NCE101YJL205C 162 nt4.38□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt4.38□□□□□ -1.71
CSE4P36012 ALA1YOR335C 2877 nt4.38□□□□□ -1.71
CSE4P36012 VPS52YDR484W 1926 nt4.37□□□□□ -1.71
CSE4P36012 APC9YLR102C 798 nt4.37□□□□□ -1.71
CSE4P36012 TAF1YGR274C 3201 nt4.36□□□□□ -1.71
CSE4P36012 SNF2YOR290C 5112 nt4.36□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YDR048CYDR048C 315 nt4.36□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YKR033CYKR033C 426 nt4.36□□□□□ -1.71
CSE4P36012 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt4.36□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YLL032CYLL032C 2478 nt4.36□□□□□ -1.71
CSE4P36012 GYL1YMR192W 2163 nt4.36□□□□□ -1.71
CSE4P36012 IOC3YFR013W 2364 nt4.35□□□□□ -1.71
CSE4P36012 DBP6YNR038W 1890 nt4.35□□□□□ -1.71
CSE4P36012 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt4.35□□□□□ -1.71
CSE4P36012 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt4.35□□□□□ -1.71
CSE4P36012 HSK3YKL138C-A 210 nt4.35□□□□□ -1.71
CSE4P36012 RPL36BYPL249C-A 303 nt4.35□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YBR064WYBR064W 429 nt4.35□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YPR014CYPR014C 330 nt4.35□□□□□ -1.71
CSE4P36012 SWD3YBR175W 948 nt4.35□□□□□ -1.71
CSE4P36012 ATP25YMR098C 1839 nt4.35□□□□□ -1.71
CSE4P36012 MSS11YMR164C 2277 nt4.34□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YDL041WYDL041W 354 nt4.34□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt4.34□□□□□ -1.71
CSE4P36012 COX23YHR116W 456 nt4.34□□□□□ -1.71
CSE4P36012 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt4.34□□□□□ -1.71
CSE4P36012 HTB2YBL002W 396 nt4.34□□□□□ -1.71
CSE4P36012 ATP15YPL271W 189 nt4.34□□□□□ -1.71
CSE4P36012 RPS23BYPR132W 438 nt4.34□□□□□ -1.71
CSE4P36012 TAF7YMR227C 1773 nt4.34□□□□□ -1.71
CSE4P36012 OSH3YHR073W 2991 nt4.33□□□□□ -1.72
CSE4P36012 NUP82YJL061W 2142 nt4.33□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YPK1YKL126W 2043 nt4.33□□□□□ -1.72
CSE4P36012 AIM9YER080W 1884 nt4.33□□□□□ -1.72
CSE4P36012 IZH3YLR023C 1632 nt4.33□□□□□ -1.72
CSE4P36012 SPT6YGR116W 4356 nt4.33□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YIL058WYIL058W 285 nt4.33□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YPL182CYPL182C 384 nt4.33□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YPR003CYPR003C 2265 nt4.33□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YCG1YDR325W 3108 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YNL034WYNL034W 1839 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 CCM1YGR150C 2595 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 SKP2YNL311C 2292 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 ULS1YOR191W 4860 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YIL102CYIL102C 306 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 RPS18BYML026C 441 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YNL170WYNL170W 396 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 HFM1YGL251C 3564 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 BIT61YJL058C 1632 nt4.32□□□□□ -1.72
CSE4P36012 FLO10YKR102W 3510 nt4.3□□□□□ -1.72
CSE4P36012 MBB1YJL199C 327 nt4.3□□□□□ -1.72
CSE4P36012 RPS8AYBL072C 603 nt4.3□□□□□ -1.72
CSE4P36012 RPL32YBL092W 393 nt4.3□□□□□ -1.72
CSE4P36012 snR191snR191 274 nt4.3□□□□□ -1.72
CSE4P36012 FUS1YCL027W 1539 nt4.3□□□□□ -1.72
CSE4P36012 XRN1YGL173C 4587 nt4.29□□□□□ -1.72
CSE4P36012 PWP2YCR057C 2772 nt4.29□□□□□ -1.72
CSE4P36012 KIP3YGL216W 2418 nt4.29□□□□□ -1.72
CSE4P36012 RPS7AYOR096W 573 nt4.29□□□□□ -1.72
CSE4P36012 NPR2YEL062W 1848 nt4.29□□□□□ -1.72
CSE4P36012 TOP1YOL006C 2310 nt4.29□□□□□ -1.72
CSE4P36012 STE6YKL209C 3873 nt4.28□□□□□ -1.72
CSE4P36012 SNT1YCR033W 3681 nt4.28□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YIL032CYIL032C 357 nt4.28□□□□□ -1.72
CSE4P36012 YLR012CYLR012C 300 nt4.28□□□□□ -1.72
CSE4P36012 ESF2YNR054C 951 nt4.28□□□□□ -1.72
CSE4P36012 CDC24YAL041W 2565 nt4.28□□□□□ -1.72
CSE4P36012 EMC1YCL045C 2283 nt4.28□□□□□ -1.72
CSE4P36012 BNI4YNL233W 2679 nt4.28□□□□□ -1.73
CSE4P36012 YGL140CYGL140C 3660 nt4.27□□□□□ -1.73
CSE4P36012 ECM5YMR176W 4236 nt4.27□□□□□ -1.73
CSE4P36012 snR79snR79 84 nt4.27□□□□□ -1.73
CSE4P36012 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt4.27□□□□□ -1.73
CSE4P36012 YHL042WYHL042W 453 nt4.27□□□□□ -1.73
CSE4P36012 RPL40AYIL148W 387 nt4.27□□□□□ -1.73
CSE4P36012 CCW14YLR390W-A 717 nt4.27□□□□□ -1.73
CSE4P36012 COG8YML071C 1824 nt4.27□□□□□ -1.73
CSE4P36012 RPA135YPR010C 3612 nt4.26□□□□□ -1.73
CSE4P36012 YJL181WYJL181W 1836 nt4.26□□□□□ -1.73
CSE4P36012 snR55snR55 98 nt4.26□□□□□ -1.73
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