Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FLT4P35916 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FLT4P35916 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT4P35916 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT4P35916 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT4P35916 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT4P35916 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT4P35916 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT4P35916 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT4P35916 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT4P35916 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT4P35916 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT4P35916 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT4P35916 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT4P35916 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT4P35916 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT4P35916 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT4P35916 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FLT4P35916 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms