Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC2P35250 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC2P35250 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC2P35250 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC2P35250 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC2P35250 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC2P35250 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC2P35250 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC2P35250 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC2P35250 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC2P35250 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC2P35250 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC2P35250 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC2P35250 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC2P35250 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC2P35250 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFC2P35250 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFC2P35250 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFC2P35250 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC2P35250 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC2P35250 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC2P35250 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC2P35250 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC2P35250 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC2P35250 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC2P35250 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC2P35250 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC2P35250 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC2P35250 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC2P35250 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC2P35250 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms