Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms