Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJA4P35212 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJA4P35212 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJA4P35212 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJA4P35212 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJA4P35212 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJA4P35212 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJA4P35212 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJA4P35212 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJA4P35212 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJA4P35212 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA4P35212 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms