Protein–RNA interactions for Protein: P34219

TOD6, Transcriptional regulatory protein TOD6, yeastyeast

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOD6P34219 ATP15YPL271W 189 nt3.31□□□□□ -1.88
TOD6P34219 MSD1YPL104W 1977 nt3.31□□□□□ -1.88
TOD6P34219 PDS5YMR076C 3834 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 SOK2YMR016C 2358 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 FAP7YDL166C 594 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 VPS55YJR044C 423 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 TIM8YJR135W-A 264 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 YBL109WYBL109W 336 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 REV1YOR346W 2958 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 YER077CYER077C 2067 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 RIM20YOR275C 1986 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 RLF2YPR018W 1821 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 COP1YDL145C 3606 nt3.3□□□□□ -1.88
TOD6P34219 URA2YJL130C 6645 nt3.29□□□□□ -1.88
TOD6P34219 RRN6YBL014C 2685 nt3.29□□□□□ -1.88
TOD6P34219 CWH41YGL027C 2502 nt3.29□□□□□ -1.88
TOD6P34219 YER189WYER189W 369 nt3.29□□□□□ -1.88
TOD6P34219 YKR033CYKR033C 426 nt3.29□□□□□ -1.88
TOD6P34219 RFC3YNL290W 1023 nt3.29□□□□□ -1.88
TOD6P34219 SWD3YBR175W 948 nt3.29□□□□□ -1.88
TOD6P34219 ALG8YOR067C 1734 nt3.29□□□□□ -1.88
TOD6P34219 TPS2YDR074W 2691 nt3.28□□□□□ -1.88
TOD6P34219 FRE8YLR047C 2061 nt3.28□□□□□ -1.88
TOD6P34219 CCT7YJL111W 1653 nt3.28□□□□□ -1.88
TOD6P34219 TMA19YKL056C 504 nt3.28□□□□□ -1.88
TOD6P34219 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.28□□□□□ -1.88
TOD6P34219 GPI1YGR216C 1830 nt3.28□□□□□ -1.88
TOD6P34219 ARG2YJL071W 1725 nt3.27□□□□□ -1.89
TOD6P34219 PKH1YDR490C 2301 nt3.27□□□□□ -1.89
TOD6P34219 BCK2YER167W 2556 nt3.27□□□□□ -1.89
TOD6P34219 AIM9YER080W 1884 nt3.27□□□□□ -1.89
TOD6P34219 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt3.27□□□□□ -1.89
TOD6P34219 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt3.27□□□□□ -1.89
TOD6P34219 PEX11YOL147C 711 nt3.27□□□□□ -1.89
TOD6P34219 ISU1YPL135W 498 nt3.27□□□□□ -1.89
TOD6P34219 RRP5YMR229C 5190 nt3.27□□□□□ -1.89
TOD6P34219 TSA2YDR453C 591 nt3.26□□□□□ -1.89
TOD6P34219 CYB5YNL111C 363 nt3.26□□□□□ -1.89
TOD6P34219 RPL32YBL092W 393 nt3.26□□□□□ -1.89
TOD6P34219 YEL025CYEL025C 3567 nt3.26□□□□□ -1.89
TOD6P34219 ISM1YPL040C 3009 nt3.26□□□□□ -1.89
TOD6P34219 MDN1YLR106C 14733 nt3.26□□□□□ -1.89
TOD6P34219 SLP1YOR154W 1764 nt3.25□□□□□ -1.89
TOD6P34219 OLI1Q0130 231 nt3.25□□□□□ -1.89
TOD6P34219 GEP4YHR100C 558 nt3.25□□□□□ -1.89
TOD6P34219 RPL23AYBL087C 414 nt3.25□□□□□ -1.89
TOD6P34219 YPL182CYPL182C 384 nt3.25□□□□□ -1.89
TOD6P34219 JJJ2YJL162C 1752 nt3.25□□□□□ -1.89
TOD6P34219 NAT1YDL040C 2565 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 RAD54YGL163C 2697 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 MRP10YDL045W-A 288 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 HPA3YEL066W 540 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 LSM1YJL124C 519 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 YLR053CYLR053C 327 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 RPS8AYBL072C 603 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 GIS2YNL255C 462 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 MIT1YEL007W 2001 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 VPS53YJL029C 2469 nt3.24□□□□□ -1.89
TOD6P34219 LCB5YLR260W 2064 nt3.23□□□□□ -1.89
TOD6P34219 NRP1YDL167C 2160 nt3.23□□□□□ -1.89
TOD6P34219 VTC1YER072W 390 nt3.23□□□□□ -1.89
TOD6P34219 FLO9YAL063C 3969 nt3.23□□□□□ -1.89
TOD6P34219 CWC22YGR278W 1734 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 USE1YGL098W 738 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 RPS23AYGR118W 438 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 IMH1YLR309C 2736 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 MPS1YDL028C 2295 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 JEN1YKL217W 1851 nt3.22□□□□□ -1.89
TOD6P34219 SLA1YBL007C 3735 nt3.21□□□□□ -1.89
TOD6P34219 SSY1YDR160W 2559 nt3.21□□□□□ -1.9
TOD6P34219 FUN12YAL035W 3009 nt3.21□□□□□ -1.9
TOD6P34219 MTC3YGL226W 372 nt3.21□□□□□ -1.9
TOD6P34219 RPL34BYIL052C 366 nt3.21□□□□□ -1.9
TOD6P34219 NCE101YJL205C 162 nt3.21□□□□□ -1.9
TOD6P34219 HHF1YBR009C 312 nt3.21□□□□□ -1.9
TOD6P34219 MNT3YIL014W 1893 nt3.21□□□□□ -1.9
TOD6P34219 VTC4YJL012C 2166 nt3.21□□□□□ -1.9
TOD6P34219 FAA1YOR317W 2103 nt3.2□□□□□ -1.9
TOD6P34219 SRL3YKR091W 741 nt3.2□□□□□ -1.9
TOD6P34219 CCW14YLR390W-A 717 nt3.2□□□□□ -1.9
TOD6P34219 SEA4YBL104C 3117 nt3.2□□□□□ -1.9
TOD6P34219 GLC3YEL011W 2115 nt3.19□□□□□ -1.9
TOD6P34219 FAA2YER015W 2235 nt3.19□□□□□ -1.9
TOD6P34219 snR60snR60 104 nt3.19□□□□□ -1.9
TOD6P34219 YDL041WYDL041W 354 nt3.19□□□□□ -1.9
TOD6P34219 YHL041WYHL041W 450 nt3.19□□□□□ -1.9
TOD6P34219 RPS21AYKR057W 264 nt3.19□□□□□ -1.9
TOD6P34219 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 252.5 ms